На базе ФНИЦ «Кристаллография и фотоника» РАН работает совет по защите диссертаций на соискание ученой степени кандидата наук, на соискание ученой степени доктора наук 24.1.245.02 по научным специальностям:
1.3.19. Лазерная физика (физико-математические науки),
1.3.21. Медицинская физика (физико-математические науки),
2.2.2. Электронная компонентная база микро- и наноэлектроники, квантовых устройств (физико-математические науки).
Институт проблем лазерных и информационных технологий РАН — филиал Федерального государственного учреждения «Федеральный научно-исследовательский центр «Кристаллография и фотоника» Российской академии наук»